PDF 【目的】利用叶绿体基因（cpDNA）标记，对近十年间在我国苹果属植物的主要密集分布区收集的15种苹果属植物的叶绿体DNA进行序列变异分析，开展其遗传分化和遗传结构研究。【方法】利用4对叶绿体DNA引物扩增722份种质的4个非编码区trnH-psbA、trnS-trnGspacer+intron、trnT-5’trnL和5’trnL-trnF，对每个基因间区正反向测序获得的序列进行人工校对后，使用MEGA7.0进行序列拼接和比对，使用DnaSPver5.10.01计算叶绿体DNA的遗传多样性参数，利用Arlequinv3.5分析标准分子变异（AMOVA），运用NetWorkver4.6.1.2构建种内居群间的叶绿体DNA单倍型邻接网络关联图。【结果】4个cpDNA区域经测序、拼接、比对和合并之后的片段长度为4120bp，共有579个多态性变异位点，单倍型为100个，核苷酸多样性（Pi）和单倍型多样性（Hd）分别为0.00852和0.879。Tajima’sD检验中，15种苹果属植物的4个cpDNA区域合并后遵循中性模型。AMOVA分析表明，遗传变异主要存在于种群内，但种群间遗传变异也占较大比重。【结论】中国原产苹果属植物在叶绿体DNA水平具有较高的遗传多样性，苹果属植物不同种具有不同的演化路线，各个种间以及种内起源演化关系错综复杂。山荆子和新疆野苹果的部分种质占据较为古老的单倍型，并在发展演化过程中经历过种群扩张。苹果属栽培种中国苹果、花红、楸子和八棱海棠的部分单倍型晚于部分新疆野苹果的单倍型。