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山核桃油体蛋白oleosin基因家族鉴定和表达模式分析

发布日期:2023/4/17 18:09:31 浏览次数:
作者:董茗秀,易芳,胡帅,高燕丽
关键词:山核桃;薄壳山核桃;Oleosin基因;生物信息学;亚细胞定位;
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20220186
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摘要:【目的】探讨山核桃中oleosin基因家族表达模式,筛选响应油脂合成的关键oleosin基因。【方法】以山核桃(Caryacathayensis)和薄壳山核桃(Caryaillinoinensis)为研究对象,利用生物信息学方法鉴定oleosin基因家族成员,分析其蛋白的理化性质、保守基序;解析基因结构、启动子区域顺式作用元件;预测oleosin基因的系统进化关系;探究oleosin基因在胚发育不同阶段的表达模式及亚细胞定位。【结果】山核桃和薄壳山核桃基因组中分别鉴定到7个和8个含“脯氨酸结”保守基序PX5SPX3P的oleosin基因家族成员,这些基因所编码的蛋白分子质量14.54~17.51 ku;启动子区域顺式作用元件分析显示,oleosin基因家族成员均含有响应光周期、逆境胁迫和激素应答等相关的顺式作用元件;系统进化分析显示15个oleosin基因家族成员主要分布在U-Oleosin、SL-Oleosin和SH-Oleosin3个亚家族;转录组数据显示,山核桃7个oleosin基因在胚发育不同阶段均表现出不同程度上调表达,其中CCA0520S0025和CCA0791S0002在山核桃胚油脂迅速增长阶段基因表达量显著上调;荧光定量PCR结果显示,山核桃oleosin基因CCA0520S0025和CCA0791S0002响应ABA和低温胁迫,同时亚细胞定位分析表明山核桃CCA0520S0025和CCA0791S0002蛋白均定位于油体。【结论】山核桃和薄壳山核桃oleosin基因家族成员均具有相似的基因结构与保守基序,亲缘关系较近,另外山核桃CCA0520S0025和CCA0791S0002可能在油脂合成过程中发挥重要作用。

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