【目的】鉴定苹果β-微管蛋白家族基因，并探究其差异表达模式，为进一步开展苹果微管蛋白的功能研究提供理论基础。【方法】基于苹果基因组数据库鉴定苹果β-微管蛋白家族成员，并对苹果β-微管蛋白家族基因进行生物信息学分析，通过实时荧光定量PCR（RT-qPCR）分析其在苹果不同砧木类型及不同组织的表达模式。【结果】苹果基因组中有13个苹果β-微管蛋白家族成员，随机分布在11条染色体上，进化树分析可将其聚为5个亚组；多序列比对和基因结构分析表明苹果β-微管蛋白家族有较强的保守性；启动子顺式作用元件分析发现脱落酸响应元件、茉莉酸甲酯响应元件和厌氧诱导元件在苹果β-微管蛋白家族基因启动子中分布最为广泛。苹果β-微管蛋白家族基因存在一定的组织表达特异性，且MdTUB4在矮化砧木的表达量显著低于乔化砧木，而MdTUB12趋势相反，表明了MdTUB4和MdTUB12可能参与调控苹果矮生。【结论】鉴定了13个β-微管蛋白家族基因，分析了其在苹果矮生中的差异表达特性，为进一步研究微管蛋白调控苹果矮生提供理论基础。
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