【目的】开发葡萄叶片和果实性状的竞争性等位基因特异性PCR(kompetitiveallelespecificPCR,KASP)标记,为葡萄分子标记辅助育种提供技术支撑。【方法】以阳光玫瑰(Vitisvinifera×V.labrusca‘ShineMuscat’)和寒香蜜(V.vinifera×V.labrusca‘SuffolkRed’)及其150个杂交后代为材料,采集叶片与成熟果实,利用Illumina平台进行PE150全基因组重测序,进行群体单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphism,SNP)检测、核心SNP筛选及KASP标记开发,并联合表型数据开展性状关联分析。【结果】获得819Gb高质量测序数据,检测到432926个SNP,筛选出74个核心SNP并成功开发19个KASP标记。KEGG富集分析显示,标记所在基因显著富集于黄酮和黄酮醇生物合成通路。通过表型-基因型关联分析筛选出14个与叶片大小(4个)、果实大小(2个)、糖含量(4个)及总酚/类黄酮含量(3个)相关的KASP标记。【结论】本研究开发的14个KASP标记可用于葡萄叶片与果实性状的早期筛选,其关联的黄酮合成等通路为品质育种提供了理论参考。



PDF