【目的】利用分子标记检测技术进行杂种鉴定和单多胚性检测,为柑橘新品种选育提供种质资源。【方法】利用分子标记技术对130株清见×鄂柑一号的杂交后代进行鉴定和亲缘关系分析,并结合形态学观察对杂交后代进行单多胚鉴定。【结果】引物CHR2-2、CHR8-3和CHR8-4能够对99.23%的杂种后代进行鉴定。通过聚类分析,大多数杂交后代与母本清见的亲缘关系比父本鄂柑一号亲缘关系近。通过对130株清见×鄂柑一号杂交后代进行单多胚鉴定分析,发现后代中多单胚和多胚子代分离比例为1∶2.42。对已挂果的44个杂交后代进行统计,发现单胚与多胚子代的比例为1∶2.38,且其中84.09%与分子标记检测结果一致。【结论】筛选出特异性引物CHR2-2、CHR8-3、CHR8-4可用于以清见为母本的杂交组合鉴定,柑橘单多胚性状可能受有害变异或多个位点的影响。