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枇杷 HD-Zip I 转录因子家族全基因组鉴定及表达模式分析

发布日期:2024/10/21 10:07:15 浏览次数:
作者:赵 双,朱静雯,陈甜甜,王鹏凯,郄红丽,王化坤,尤伟忠
关键词:枇杷;HD-Zip I转录因子;全基因组鉴定;表达分析
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20240362
全文: PDF 摘要全文阅读

目的】同源结构域-亮氨酸拉链(HD-Zip)转录因子参与多种植物的非生物胁迫响应过程。然而,在枇杷中,HD-ZipI基因家族尚未被鉴定。【方法】利用生物信息学方法对全基因组范围内枇杷HD-ZipI基因家族成员进行鉴定和综合分析,通过qRT-PCR法分析基因家族成员在枇杷不同组织和干旱胁迫下的表达特征。【结果】在枇杷基因组中筛选出20HD-ZipI家族成员。共线性分析结果发现了3对串联复制序列和22对片段复制序列,表明串联复制和片段复制可能促进了枇杷HD-ZipI基因家族的扩张。蛋白序列比对分析表明,所有的HD-ZipI家族成员均具有高度保守的HDZip结构域。系统发育分析表明,枇杷HD-ZipI家族可以分为7个分支。HD-ZipI各基因在枇杷不同组织中的表达模式有所差异。启动子序列分析表明,HD-ZipI家族成员的启动子上含有多个与干旱胁迫和胁迫相关激素信号响应的顺式作用元件。干旱处理能够诱导EjHB9EjHB10EjHB17EjHB18EjHB20在叶片中的表达显著上调,预示着这些基因参与枇杷对干旱胁迫的响应。【结论】鉴定出5个受干旱胁迫显著诱导表达的枇杷HD-ZipI基因,为进一步研究HD-ZipI基因在响应枇杷干旱胁迫中的分子功能提供理论依据。

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