稿件远程管理系统

编辑办公系统
专家审稿系统
投稿查稿系统

联系编辑部

电话:
0371-63387308 65330928
邮箱:guoshuxuebao@caas.cn

访问量

今日访问:
昨日访问:
本月访问:
总访问:
您的位置:首页在线期刊2023年第8期

基于SLAF-seq技术的不同类型越橘遗传变异和群体结构研究

发布日期:2023/8/25 9:13:30 浏览次数:
作者:刘有春,李嘉琦,魏鑫,杨艳敏,张舵,王兴东,孙斌, 杨玉春,王升,高树清,王宏光,徐艺格,袁兴福,刘成
关键词:越橘;SLAF-seq技术;SNP;遗传群体结构
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20230008
全文: PDF 摘要全文阅读

摘 要:目的】利用越橘属栽培品种及野生资源在全基因组范围内筛选差异SNP分子标记,分析其遗传变异,了解不同类型群体间的遗传变异、基因交流、群体结构,为越橘种质创新提供遗传背景依据。【方法】以越橘属9个种的62份种质资源为材料,利用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)获得的基因组SNP标记比对到品种Draper参考基因组 上,进行供试材料遗传研究。【结果】测序获得169.87 Mb reads数据,平均Q3094.99%,包含172513个多态性SLAF标 签,筛选到高质量SNP标记4133595个,均匀分布在越橘12条染色体上。基于SNP标记的系统进化树准确反映了供试野生、北高丛和南高丛类群遗传差异以及品种间系谱遗传关系,反映出野生类型与栽培品种遗传差异显著,供试野生种具有独立的遗传背景且种间无基因交流发生,但野生种到栽培种存在单向的基因流;栽培品种类群存在明显的亚群结构,亚群间存在普遍的基因交流;半高丛品种北陆和南高丛品种军号与北高丛类型紧密聚类,矮丛品种美登、半高丛品种北村、黑珍珠遗传背景倾向于野生种。【结论】栽培品种近亲杂交和骨干亲本高频率使用导致品种间基因交流频 繁、同质性高、遗传基础狭窄,野生种具有独立的遗传背景,但存在野生种到栽培种的单向基因流,应加大野生资源发掘利用以拓宽越橘遗传基础。

全文阅读...