miR403分子进化特性及其在龙眼 体胚发生早期的表达模式分析

摘要：【目的】探究miR403的分子进化特性及其在龙眼体胚发生早期中的表达模式。【方法】根据龙眼转录组数据库 结合miRBase数据库下载得到植物miR403成熟体（miRNA，MicroRNA）和前体（pre-miRNA，Precursor MicroRNA）序 列，对其构建系统发育树、序列多重比对、前体二级结构分析；并克隆龙眼miR403 5’末端cDNA序列，比较miR403启 动子顺式作用元件。利用qPCR（Quantitative real time-PCR）探究龙眼体胚发生早期miR403和pre-miR403的表达模 式。【结果】龙眼及其他17个物种中miR403的36个前体和42成熟体序列的系统发育树以及序列多重比对显示，植物 miR403高度保守且主要来源于pre-miR403的3臂，而pre-miR403分歧较大，序列仅在miRNA生成区域保守；不同物 种之间 miR403成员数量差异不大；pre-miR403 最小折叠自由能为-35.70 ~ -55.50 kal · mol- 1 。克隆获得龙眼 primiR403（miR403初级体）5’末端cDNA序列，确认其第一个碱基A为转录起始位点（TSS，transcription start site）。龙眼 等5种植物MIR403启动子中具有大量光、激素和逆境胁迫等元件。龙眼早期体胚发生过程中miR403和pre-miR403 整体为显著下调趋势。【结论】龙眼miR403与其他植物miR403具有高度的保守性以及物种之间的特异性，miR403和 pre-miR403下调表达可能有利于促进龙眼早期体胚发生。