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杜梨NHX基因家族的鉴定及其 在非生物胁迫下的表达分析

发布日期:2023/5/15 15:28:37 浏览次数:
作者:王影,李慧,蔺经,杨青松,张绍铃,常有宏
关键词:杜梨;NHX基因家族;非生物胁迫;实时定量PCR
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20180347
全文: PDF 摘要

摘要:目的NHX基因亚家族为钠氢逆转运体,具有Na+ /H+ exchangePF00999)蛋白结构域,广泛存在于多种物种 中,主要参与植物响应盐胁迫过程离子平衡的重建。分析鉴定杜梨中NHX基因及其耐盐机制有助于实际生产中更为 有效地利用这一砧木资源。【方法】结合已公布的梨基因组数据以及拟南芥相关数据,通过生物信息学手段,鉴定杜梨 NHX基因家族成员;通过MEGA7.0软件进行序列比对以及进化分析;通过在线工具PfamSMART以及GSDS进行基因结构分析;通过定量PCR技术分析非生物胁迫下基因在不同组织中的表达特征;应用火焰石墨炉原子吸收光谱仪 测定NaCl胁迫下杜梨不同组织中Na+ K+ 含量。【结果】成功鉴定出16个候选基因,其中有4个基因属于NHX亚家族, 4个基因属于CHX亚家族,8个基因属于KEA亚家族。预测的候选基因均含有Na+ /H+ exchange功能域;NaCl胁迫下, 预测的16个基因在叶片中的表达差异大,但在8 h以后均为负调控;在茎中,PEG6000处理下,PbNHX1的表达量显著增高,且高于同一时期NaCl胁迫下的表达水平,仅在48 h时低于同一时期NaCl胁迫下的表达水平;在根中,基因PbNHX12PbNHX13PbNHX14PbNHX15NaCl胁迫和PEG6000处理下在任何时间段均为负调控。【结论】在盐胁迫过程中,与拟南芥NHX基因进化关系最近的PbNHX1PbNHX11呈现出负调控模式,与拟南芥KEA基因进化关系相近 的PbNHX10PbNHX7可能参与K+ 的运输。

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