- 作者:申艳红，姜涛，刘璐琪，石天磊，赵湾湾，陈晓静
- 关键词:番木瓜；乙烯；小RNA；高通量测序；果实
- DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20190229
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摘要：【目的】番木瓜是典型的呼吸跃变型果实，外源乙烯处理使番木瓜呼吸跃变提前，促进果实成熟。分离番木瓜果实成熟相关miRNA，为深入了解呼吸跃变型果实的成熟分子机制奠定基础。【方法】利用高通量测序技术对乙烯（ETH）、1-MCP和清水对照（CG）处理的番木瓜果实进行miRNA和转录组高通量测序，然后对测序获得数据进行生物信息学分析，进行miRNA鉴定和靶基因预测，并与转录组测序结果进行关联分析。【结果】乙烯、1-MCP和对照处理分别获得10 734 196、16 486 803 和 16 067 290 条纯净序列，共鉴定出 523 个 miRNA。其中，已知 miRNA 个数为 1-MCP （303）、CG（214）和 ETH（239），新 miRNA个数为 1-MCP（184）、CG（188）和 ETH（114）。与对照相比，在乙烯处理中上调和下调表达的miRNA分别是123和72条。靶基因预测共获得5 053个靶基因，KEGG功能富集分析显示它们参与了戊糖、葡萄糖醛酸转换、淀粉和蔗糖代谢、卟啉和叶绿素代谢、类胡萝卜素合成等代谢途径。筛选出的番木瓜果实成熟衰老相关候选miRNA，包含4个果实软化调控相关miRNA（miR167-y、miR4993-x、miR3946-x和miR5059-x）、3个果实颜色调控相关miRNA（miR4993-x、miR815-y 和 miR7810-x）、3 个激素调控相关 miRNA（miR4993-x、miR8004-x 和 miR9722-x）和4个转录因子调控相关miRNA（miR5641-y、miR9722-x、miR838-y和miR319-y）。【结论】筛选的番木瓜果 实成熟衰老相关miRNA为今后果实成熟衰老调控网络研究提供了可能的线索。