香蕉条斑病毒ORF I基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析

摘要：【目的】探明杆状DNA病毒属病毒的ORFⅠ基因功能。【方法】本研究从香蕉条斑病毒云南分离株(BSV-YN)中克隆了BSV ORFⅠ基因，通过核苷酸和氨基酸序列分析和同源关系分析，确定了BSV-YN的分类地位；对其编码蛋白及同源物的理化性质、氨基酸序列组成、亲疏水性、跨膜区域、信号肽、亚细胞定位、磷酸化位点、同源结构域、蛋白二级 和三级结构等进行预测和分析。【结果】BSV ORFⅠ基因片段大小为528 bp，编码175个氨基酸，通过核苷酸和氨基酸 序列分析和同源关系分析，确定了 BSV-YN属于 BSGFV种。生物信息学分析表明，BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白都是 不稳定的、亲水性蛋白，以丝氨酸和苏氨酸磷酸化为主。这些蛋白二级结构主要由α-螺旋和无规则卷曲组成，无信号 肽或跨膜区域。亚细胞定位预测表明，BSV-YN ORFⅠ及同源蛋白主要在细胞核分布，推测它们在病毒感染的宿主细 胞核中发挥重要作用。【结论】推测BSV-YN ORFⅠ在病毒感染的宿主细胞核中参与病毒复制、转录等相关过程。本研 究为进一步开展该蛋白的功能研究提供科学线索。