- 作者:鱼尚奇,贾昌路,宋岩,刘春花,郭永翠,张文涛,陈立平,张锐
- 关键词:核桃内果皮;差异表达基因;表达模式分析;功能显著性富集分析
- DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20180436
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摘要:【目的】综合分析纸皮核桃内果皮硬化期转录本表达情况,获得3个代表样本间差异表达基因,为系统研究纸 皮核桃内果皮木质化的分子机理打下基础。【方法】采用转录组测序技术对其内果皮硬化期3个样品测序,利用生物信 息学方法和软件筛选样本间的差异表达基因并进行生物学功能预测。【结果】通过 Trinity 软件拼接得到 76 814 条 Unigene,筛选出了609个差异表达基因,利用Gene Ontology和KEGG数据库对差异表达基因注释,发现差异表达基因 显著富集在植物激素信号转导、苯丙烷类生物合成、苯丙氨酸代谢、ABC转运子合成、泛醌和其他萜类醌生物合成等 途径中。【结论】筛出了纸皮核桃内果皮硬化期差异表达基因显著富集的主要代谢途径,为今后系统研究纸皮核桃内果 皮木质化的分子机理打下了良好基础。