葡萄PLATZ家族基因鉴定及其在种子发育过程中的表达分析

摘要：【目的】鉴定葡萄PLATZ(PlantAT-richsequenceandzinc-bindingprotein)家族转录因子，并探究其在种子发育过程中与IAA处理下的表达模式变化。【方法】基于葡萄基因组数据，通过多种生物信息学方法对葡萄PLATZ家族成员进行鉴定和分析，利用qRT-PCR分析其在葡萄种子不同发育时期及IAA处理下的表达模式。【结果】葡萄全基因组范围内共鉴定到13个PLATZ成员，分布于9条染色体上。系统进化分析结果表明，葡萄PLATZ蛋白成员分为4组（A、B、C、D），无其他物种聚类的E组成员。蛋白保守基序分析表明葡萄PLATZ蛋白具有较强保守性，内含子-外显子分布表明葡萄PLATZ基因在进化上具有多样性。同线性分析发现，VvPLATZ7～VvPLATZ8和VvPLATZ5～VvPLATZ11存在并联重复。顺式作用元件分析发现该基因家族的启动子包含生长发育、光响应、激素响应及胁迫响应相关作用元件。qRT-PCR结果分析表明，VvPLATZ5在无核葡萄种子发育过程中表达水平显著高于有核葡萄，VvPLATZ2和VvPLATZ6在有核葡萄种子发育过程中表达水平显著高于无核葡萄；8个VvPLATZ基因均响应IAA处理，且VvPLATZ5和VvPLATZ12基因在处理后6h表达水平上调幅度显著。【结论】在葡萄基因组共鉴定到13个PLATZ基因，进化上同组成员保守基序数目及类别具有保守性，基因内含子-外显子结构具有多样性。PLATZ基因在有核、无核葡萄种子发育不同时期表达模式存在差异，且显著响应IAA处理，推测其在葡萄种子发育过程中发挥作用。