- 作者:周婉莹,曲东 ,张晓娟,张文慧,刘艳飞,张 羽
- 关键词:猕猴桃;Fasciclin;生物信息;性别;克隆
- DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20200011
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摘要:【目的】探讨fasciclin基因在中华猕猴桃中的生物信息。【方法】对中华猕猴桃雌株38个fasciclin基因进行生物 信息学分析和克隆其中一个与性别相关的fasciclin基因。【结果】38个fasciclin基因编码133~606个氨基酸。丝氨酸、 苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点范围分别为 10~56 个、2~26 个、0~8 个。38 个 fasciclin 基因拥有 1~9 个 motif 结构(取值 10),其中Motif3为共同具有。68.42% fasciclin蛋白为不稳定疏水性蛋白。2 000 bp启动子区共预测到TFs 110个,较多的TFs依次为BBR-BPC、TALE和AP2,9个基因没有预测到TFs结合位点。UPGMA聚类法把38个fasciclin蛋白分 成2类。基因克隆序列(723 bp)具有fasciclin保守结构域,该序列只比对到8号染色体上。【结论】fasciclin基因保守性 不强;克隆序列与中华猕猴桃雌雄性状显著关联,但与美味猕猴桃雌雄无关联;雌株中的同源区没有注释到基因。