龙眼HDAC家族成员的全基因组鉴定及表达分析

摘要：【目的】研究龙眼HDAC家族的进化特性及其在体胚发生过程及不同激素处理下的表达模式。【方法】对龙眼 HDAC（DlHDAC）家族成员进行全基因组鉴定及生物信息学分析，结合转录组数据分析DlHDAC家族在龙眼非胚性及 胚性培养物及不同组织器官中的表达情况，采用qRT-PCR检测龙眼体胚发生过程及不同激素处理下DlHDAC家族的 表达模式。【结果】DlHDAC家族可分为RPD3/HDA1、HD2和SIR2亚家族，均为亲水性蛋白质，亚细胞定位显示主要分 布于细胞核中。RPD3/HDA1亚家族含有HDAC结构域，HD2亚家族含有C2H2型锌指和Nucleoplasmin结构域，SIR2 亚家族含有SIR2结构域。RPD3/HDA1和SIR2亚家族蛋白结构以α-螺旋和无规则卷曲为主，HD2亚家族以无规则卷 曲为主。DlHDAC启动子序列中包含众多光响应、激素应答、胁迫响应及与植物生长相关作用元件；转录组数据显示 DlHDAC家族大部分成员在ICpEC和GE阶段高表达；且在龙眼果实，种子及根中高表达。qPCR分析显示，DlHDA6、 DlSRT1-1、DlHDT1 和 DlHDT3 在 GE 阶段上调表达；在脱落酸（ABA）、茉莉酸甲酯（MeJA）、赤霉素（GA3）和水杨酸 （SA）处理下DlHDA8、DlHDA9、lSRT1-1、DlSRT2、DlHDT1和DlHDT3均被不同程度地诱导表达。【结论】DlHDAC在进 化过程中保守性与特异性并存，可能参与龙眼果实、种子及根的生长发育过程，并通过响应ABA、SA和GA3的表达来 调控龙眼体胚发生。