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石榴MAPK家族基因鉴定及其响应冷胁迫的表达分析

发布日期:2023/10/31 11:19:54 浏览次数:
作者:陈利娜,曹尚银,唐丽颖,李好先,严琼,李松开,杨庆华,鲁振华
关键词:石榴;籽粒硬度;抗寒性;MAPK;表达分析
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20230136
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摘要目的】评价不同石榴种质资源籽粒硬度及抗寒性,筛选可能参与调控石榴抗寒性的MAPK家族基因。【方法】31份石榴种质资源为试材,进行抗寒性及籽粒硬度评价;基于全基因组筛选石榴MAPK家族基因,对其进行进化、基因结构和蛋白理化性质分析,同时利用实时荧光定量PCRreal-timequantitativePCRqRT-PCR)分析冷胁迫对石榴MAPK家族基因表达模式的影响。【结果31个石榴品种籽粒硬度及半致死温度测定结果表明,峄城粉红牡丹、淮北六棱甜和鲁白榴2号等硬籽石榴抗寒性较强,华紫、以3和玛丽斯等软籽石榴抗寒性较弱。基于石榴全基因组鉴定出17MAPK家族基因,广泛分布于8条染色体上;MAPK家族所有成员主要分为3个亚类,其中,AB亚类成员主要包含PKc_MAPKK_plant_likePTZ00024结构域,C亚类主要包含PLN00034结构域,所有成员均具有S_TKc结构域;各成员氨基酸残基数量分布在314~860aa,外显子数目1~18个,蛋白分子质量为34910.05~97965.26u,等电点4.94~9.35PgMKK2PgMPK6PgMPK9PgMPK16PgMPK13在峄城粉红牡丹响应冷胁迫过程中表现为显著上调,PgMKK8PgMPK1-1PgMKK4在玛丽斯响应冷胁迫过程中表现为显著上调;PgMKK2PgMPK6PgMPK9PgMPK16PgMPK13在峄城粉红牡丹响应冷胁迫过程中的表达量显著高于玛丽斯,PgMKK8PgMPK1-1在玛丽斯响应冷胁迫过程中的表达量显著性高于峄城粉红牡丹;PgMKK3在峄城粉红牡丹不同时间均未检测到表达,在玛丽斯中表现为先升高后降低的趋势;PgMPK12-2在玛丽斯不同时间均未检测到表达,在峄城粉红牡丹中表现为逐渐升高的趋势。【结论】石榴MAPK家族基因响应冷胁迫信号,其中,PgMKK2PgMPK6PgMPK12-2PgMPK9可能参与正调控石榴的抗寒性。

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