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甜瓜自毒胁迫响应基因CmFe-SOD的克隆及表达分析

发布日期:2019/3/7 10:54:29 浏览次数:
作者:张政达 王景荣 陈丽辉 樊佳茹 韩晓云 王革伏 张志忠
关键词:甜瓜; 自毒胁迫; 根系分泌物; Fe-SOD基因; 亚细胞定位; qRT-PCR;
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20180132
全文: PDF 摘要

【目的】克隆根系分泌物介导的甜瓜自毒胁迫响应基因Fe-SOD, 分析基因序列特征和表达情况, 探讨其功能。【方法】以甜瓜幼苗为材料, 通过RT-PCR技术克隆Fe-SOD基因, 命名为CmFe-SOD, 进行生物信息学分析和亚细胞定位;通过qRT-PCR技术分析CmFe-SOD在自毒胁迫后甜瓜幼苗叶片和根系中的表达模式。【结果】CmFe-SOD基因组DNA全长1 255 bp, 开放阅读框918 bp, 编码305个氨基酸。生物信息学分析显示CmFe-SOD为酸性亲水蛋白, 无信号肽和跨膜区域, 二级结构中无规则卷曲比例最高, 与三级结构预测结果一致, 基因序列包含典型的Fe-SOD蛋白结构域。同源性分析表明, 不同来源Fe-SOD在氨基酸序列上具有较高同源性, CmFe-SOD蛋白与黄瓜的关系较近。通过洋葱内表皮GFP荧光定位观察发现, CmFe-SOD定位于细胞质;qRT-PCR结果显示, 根系分泌物处理后甜瓜幼苗叶片中CmFe-SOD基因表达水平整体呈增加趋势, 在24 h时表达量最高;在根系中呈现先增加后下降趋势, 6 h时表达量最高。【结论】CmFe-SOD基因在进化上较保守, 参与了甜瓜根系分泌物介导的自毒胁迫响应, 自毒胁迫后在叶片中表达量呈持续上升的趋势, 在根部呈现先上升后下降的趋势。