枇杷属植物3个新S基因鉴定及大渡河枇杷分类地位的新证据

摘要：【目的】鉴定枇杷属普通枇杷野生种、栎叶枇杷和大渡河枇杷3个种的S-RNase基因型, 为利用其优良性状开展种质创新, 以及大渡河枇杷分类地位的探讨提供科学依据。【方法】以苹果S-RNase基因高度保守区设计兼并引物对3个种的基因组DNA进行PCR扩增, 片段回收、克隆及测序, 分别采用BLASTn、BLASTx、DNAMAN和CLUSTALW软件进行同源性检索、序列比对和结构分析。【结果】从参试的3个种中共分离了4个S等位基因, 分别为S2-RNase、S26-RNase、S32-RNase和S34-RNase, 其中S26-RNase、S32-RNase和S34-RNase为新分离的枇杷S-RNase基因, GenBank登录号分别为:MG765271、MG846012和MG812504。所克隆获得的4个枇杷S-RNase基因与苹果S-RNase基因的氨基酸序列结构相同, 具有5个保守区 (C1、C2、C3、RC4和C5) 和1个高变区 (HV) 。此外, 所获得的4个枇杷S-RNase基因电泳图谱及同源性和进化分析结果表明, 大渡河枇杷可能为普通枇杷和栎叶枇杷的杂交后代。【结论】确定了普通枇杷野生种、栎叶枇杷和大渡河枇杷的S-RNase基因型分别为S2S26、S32S34和S26S32。大渡河枇杷S-RNase基因型及S-RNase的同源性和系统进化分析结果支持其可能为普通枇杷和栎叶枇杷杂交后代的结论。