甜樱桃成花相关MADS-box基因的克隆及表达分析

PDF阅读 日期：2019/2/28 10:54:50 浏览： 次
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【目的】克隆甜樱桃中可能参与成花途径的MADS基因, 分析其基本信息, 研究其在不同组织中的表达情况。【方法】以甜樱桃‘萨米特’ (‘Summit’) 为试材, 结合桃基因组分析, 克隆得到14个可能参与成花的MADS基因, 分别命名为PaSOC1、PaAG、PaAP1、PaAP1-2、PaAP3、PaPI、PaSVP、PaAGL24、PaSEP1、PaSEP2、PaSEP3、PaSEP4、PaSEP5、PaFLC, 通过DNAMAN、SMART、protein BLAST和MEGA5等软件分析14个甜樱桃的MADS基因结构、氨基酸结构域及其进化关系, RT-PCR检测其在樱桃根、叶芽、叶、花芽、花、韧皮部中的表达模式。【结果】14个甜樱桃MADS成员大小为612765 bp, 均含有典型的MADS结构域和K-box结构域, 含有68个内含子。分属7个亚组, PaSEP1、PaSEP2、PaSEP3、PaSEP4、PaSEP5属于SEP亚组, PaAP1、PaAP1-2属于AP1亚组, PaAG属于AG亚组, PaSOC1属于SOC1亚组, PaAP3和PaPI属于AP3/PI亚组, PaSVP属于SVP亚组, PaAGL24属于AGL24亚组, PaFLC并未聚到FLC亚组中。RT-PCR分析显示, 14个MADS基因在花芽或花中均有不同程度的表达, 此外, 除PaAP3、PaSEP1、PaSEP4及PaSEP5之外, 其他几个基因在韧皮部中也有不同程度的表达。【结论】获得的甜樱桃MADS-box基因结构高度保守, 参与调控成花及花发育过程。