2个中亚杏S-RNase基因全长的克隆与序列分析

PDF阅读 日期：2018/1/15 8:57:11 浏览： 次
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【目的】克隆中亚杏（Prunus armeniaca）品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列,为分子手段调控杏自交不亲和性状奠定基础。【方法】以新疆栽培杏品种‘索格佳娜丽’和‘赛买提’为试材,利用RT-PCR克隆2个品种的花柱SRNase基因c DNA片段,RACE技术进行c DNA全长克隆,采用BLAST进行序列比对,Protparam软件分析2个基因的编码蛋白特性,MEGA 5.0构建进化树。【结果】从‘索格佳娜丽’中克隆了S₅₂-RNase（KF951503）基因,从‘赛买提’中克隆了一个新的S₅₃-RNase（KF975455）基因DNA和c DNA全长序列。S₅₂-RNase的DNA全长2 200 bp,c DNA全长765 bp,ORF（开放阅读框）长681 bp,编码226个氨基酸;S₅₃-RNase的DNA全长1 664 bp,c DNA全长907 bp,ORF长732 bp,编码242个氨基酸。BLASTP比对显示:这2个基因都具有保守的RNase-T2基因结构,属于RNase-T2家族。预测相对分子质量分别为26.5 ku和27.5 ku,等电点为9.36和9.03,都属于亲水性蛋白。进化分析表明,S₅₂与李（Prunus salicina,S₇）、S₅₃与大岛樱(Prunus speciosa,S₁₃)亲缘关系最近,S₅₂和S₅₃处在2个不同的分支上,表现出较高的序列多态性,表明2个基因亲缘关系较远。【结论】获得了2个中亚杏品种自交不亲和花柱S-RNase基因全长序列。