杧果MiCO 基因的克隆与表达模式分析

PDF阅读 日期：2017/5/8 10:34:30 浏览： 次
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【目的】克隆杧果（Mangifera indica L.）MiCO 基因并探讨其表达模式，为深入研究该基因的功能奠定基础。【方法】根据从杧果转录组测序数据中获得一个MiCO 基因全长序列信息，设计基因全长引物，克隆具有不同开花习性的‘四季杧’和‘紫花杧’2个品种的MiCO 基因全长序列，对其序列进行生物信息学分析，并利用荧光定量PCR技术对MiCO 基因在杧果不同组织以及年周期的表达情况进行分析。【结果】序列分析显示，2个杧果品种的MiCO 基因cDNA全长均为1 150 bp，都包含1个966 bp的开放阅读框，编码322个氨基酸，等电点为5.8，‘四季杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.30 ku，‘紫花杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.22 ku；MiCO 基因编码的蛋白具有典型的CO同源蛋白结构，包括B-box1、B-box2和CCT结构域；系统进化树表明，杧果MiCO蛋白属于第一类CO蛋白，与拟南芥（Arabidopsisthaliana）AtCOL4相似性最高而聚类到一起。基因表达分析表明，MiCO 基因在杧果不同组织中均表达，但不同组织的表达水平存在差异。年周期表达分析表明，MiCO 基因在杧果成花转变期高度表达，而且在来年的5—6月还存在一个小的表达高峰期，但2个品种不同组织中MiCO 基因表达存在差异。【结论】克隆获得杧果MiCO 基因全长序列，发现2个具有不同开花习性的杧果品种的MiCO 基因核苷酸和氨基酸序列高度同源，只存在少许差异。MiCO 基因在杧果成花转变期高度表达，说明MiCO 基因与杧果成花关系密切。