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枇杷HD-Zip I转录因子家族全基因组鉴定及表达模式分析

发布日期:2024/9/4 9:05:21 浏览次数:

目的同源结构域-亮氨酸拉链HD-Zip)转录因子参与多植物非生物胁迫响应过程。然而,在枇杷中,HD-Zip I基因家族尚未被鉴定。【方法】利用生物信息学方法对全基因组范围内枇杷HD-Zip I基因家族成员进行鉴定和综合分析,通过qRT-PCR法分析它们在枇杷不同组织和干旱胁迫下的表达特征。【结果】本研究中,笔者在枇杷基因组中筛选出20HD-Zip I家族成员线性分析结果发现了3对串联复制序列和22片段复制序列表明串联复制和片段复制可能促进了枇杷HD-Zip I基因家族的扩展。蛋白序列比对分析显示,所有的HD-Zip I家族成员均具有高度保守的HDZip结构域。系统发育分析表明枇杷HD-Zip I家族可以分为7个分支HD-Zip I各成员在枇杷不同组织中的表达模式有所差异。启动子序列分析表明HD-Zip I家族成员的启动子上含有多个与干旱胁迫和胁迫相关激素信号响应的顺式作用元件。干旱处理能够诱导EjHB9EjHB10EjHB17EjHB18EjHB20在叶片中的表达显著上调,预示着这些基因参与枇杷对干旱胁迫的响应。【结论】鉴定出5个受干旱胁迫显著诱导表达的枇杷HD-Zip I基因,为进一步研究HD-Zip I基因在响应枇杷干旱胁迫中的分子功能提供理论依据




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