PDF 【目的】开发桑树特异性分子标记，系统解析桑树种质资源的遗传多样性，为种质鉴定、亲缘关系分析和核心种质筛选提供依据，进而服务于桑树育种材料的高效利用与种质创新。【方法】以46份桑树种质为供试材料，基于桑树基因组重测序数据筛选设计Indel（insertion-deletion）引物，通过单因素和正交试验优化InDel-PCR反应体系，并进行遗传多样性分析。【结果】InDel-PCR最佳反应体系为：Buffer（含Mg2+）2.0µL，2.5mmol·L-1dNTP0.4μL，上、下游引物（10μmol·μL-1）各0.8μL，TaqDNA聚合酶（5U·μL-1）0.25μL，DNA（50ng·μL-1）1μL，ddH2O14.75μL。扩增程序为95℃预变性3min，94℃变性30s、58℃退火60s、72℃延伸60s，30个循环，72℃延伸10min，4℃保存。基于优化的InDel分子标记体系，对42份桑树种质开展遗传多样性检测及UPGMA（UnweightedPairGroupMethodwithArithmeticMean）聚类分析。供试种质间遗传分化显著，群体呈中等偏上遗传多样性水平；平均遗传距离为0.3729，期望杂合度（H）平均值达0.3507，香农信息指数（I）均值为0.5338。【结论】桑树材料分为六大类，揭示了桑树种质间复杂的关系。研究结果可为桑树分子标记数据库的完善、种质资源的鉴定和分子辅助选育提供了科学依据。