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甜樱桃 TCP 家族全基因组鉴定及在非生物胁迫下的表达分析

发布日期:2026/8/21 9:23:06 浏览次数:
作者:程 亮,彭 海,刘博华
关键词:甜樱桃砧木;TCP蛋白;基因家族;生物信息学
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20250604
全文: PDF 摘要全文阅读

【目的】深入解析TCP家族基因在甜樱桃中的表达模式,探究其在Gisela17砧木响应非生物胁迫过程中的功能,以期为分子育种提供候选基因资源。【方法】利用生物信息学对甜樱桃TCP基因家族进行全基因组鉴定,并结合qRT-PCR分析甜樱桃砧木Gisela17在不同非生物胁迫下TCP基因的表达特征。【结果】在甜樱桃基因组中鉴定出19PaTCP基因,分布在7条染色体上,所有蛋白均含有完整的TCP保守结构域。编码区长度268~601aa,外显子数1~2,亲水指数均为正值;亚细胞预测显示,PaTCP1~17均定位于细胞核。系统发育与序列特征联合分析将19PaTCP成员分为ClassⅠ(PCF)与ClassⅡ(CINCYC/TB1)两大支。共线性分析发现6对片段重复事件,提示扩增主要源于片段复制。甜樱桃与其近缘核果类果树(桃、李、杏)间共线性对较多,与单子叶植物水稻间最少。PaTCP启动子区富集逆境与激素响应顺式元件。qRT-PCR结果显示,在干旱、盐、缺铁三种胁迫处理下,PaTCP1/3/4/7/9/10/15/17/18/192448h均显著上调;PaTCP2/8/11/12/13/16整体下调;PaTCP14对干旱无显著应答,但对盐与缺铁表现出特异性诱导。【结论】通过分析甜樱桃Gisela17砧木在响应不同逆境下的特异性分子应答机制与协同抗逆调控规律,系统阐释其抵御干旱损伤、盐离子毒害、缺铁失绿的内在分子机制,旨在为Gisela17砧木抗逆种质鉴定、关键抗逆基因的挖掘与功能验证、抗逆分子机制深度解析提供坚实的理论依据。

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