基于 SSR 标记的中亚生态区核桃（Juglans regia L.）遗传多样性与种群结构分析

【目的】从分子水平探究中国新疆与吉尔吉斯斯坦和塔吉克斯坦2个中亚国家共6个区域核桃种质资源间的遗传多样性及亲缘关系。【方法】采用SSR分子标记方法对采自6个区域的137份核桃种质资源进行遗传多样性和居群遗传结构分析。【结果】利用14对引物共检测到130个等位变异位点，变异范围为6~13，平均每对SSR引物可检测到9.2857个等位位点；14个SSR位点的占比范围为0.6257~0.8651，平均值0.7634；平均Shannon’s多样性指数（I）为0.4598；种群总基因多样性（Ht）平均值为3.2481；种群内基因多样性（Hs）平均值为2.1089；种群间的遗传分化指数（Gst）范围为0.0578~0.4068，平均值为0.2595；基因流（Nm）平均值为3.0174；各个等位基因频率整体分布不均匀。UPGMA聚类结果显示，137份供试材料在遗传相似性系数为0.75时分成3个类群。其中，第一类群共42份，包括中国新疆阿克苏地区16份，中国新疆和田地区21份，吉尔吉斯斯坦5份；第二类群共44份，包括中国新疆伊犁地区12份、吉尔吉斯斯坦32份；第三类群共51份，包括中国新疆喀什地区19份、塔吉克斯坦13份和中国新疆伊犁地区19份。聚类结果在一定程度上表明了居群间亲缘关系的距离，总体分布与地理分布有关，不同区域之间存在一定的基因交换。聚类结果与居群间遗传距离和遗传一致度结果一致。【结论】SSR分子标记结果表明，中亚生态区不同地理分布的核桃种质资源遗传多样性存在差异，为揭示中亚生态区核桃种群结构及传播途径提供了依据。