- 作者:亢 超,郭彩华,张雪蒙,刘金明,袁 星,全绍文,牛建新
- 关键词:核桃;NAC基因家族;生物信息学;表达模式
- DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20210158
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【目的】探究核桃中的NAC转录因子及其在花器官形成过程中的表达特性。【方法】利用转录组和基因组数据库,结合生物信息学方法,对核桃NAC基因家族进行鉴定,并就其理化性质、亚细胞定位、系统发育、基因结构、保守基序、染色体定位、基因复制及蛋白调控网络进行分析。【结果】核桃中共鉴定到121个NAC家族成员,它们在16条染色体上不均等分布,根据系统发育树,核桃所有NAC成员被分为15个亚族;基因结构显示,大部分JrNAC成员含有3个外显子;共线性分析表明,核桃中有4个NAC基因在其他3个物种中均具有同源基因,且其中的2个基因(JrNAC44和JrNAC108)在核桃基因组中出现基因复制现象。基因表达分析显示,7个JrNAC基因在雌雄花芽的3个时期均高表达,特别是JrNAC8和JrNAC115。【结论】核桃NAC基因较为保守,但仍发挥多样性的功能。JrNAC2、JrNAC8、JrNAC115和JrNAC97基因可能为核桃花器官发育过程中的关键基因。