PDF 摘要：【目的】通过比较砂糖橘和砂糖灯笼橘性状差异及利用转录组测序数据，筛选砂糖橘和砂糖灯笼橘叶、果肉、橘络、橘皮之间的差异基因，探究砂糖橘自然变异品种砂糖灯笼橘橘皮、叶中与蜡质生物合成相关的显著差异基因。【方法】分别取同一生长时期的砂糖灯笼橘和砂糖橘进行观察记录，取叶、果肉、橘络、橘皮4个组织样本，液氮速冻，设立3个生物学重复进行转录组测序。分析2个物种间的转录组测序结果，寻找关键差异基因。【结果】通过砂糖灯笼橘与砂糖橘对比，砂糖灯笼橘叶较大、卷曲，边缘性状不规则；果实偏大，果皮表面布满沟壑，存在较多点状突起，同时叶和果皮部位存在蜡质缺失。砂糖灯笼橘叶存在差异基因数量最多，其次为果肉、皮、橘络，差异基因主要参与的功能为蛋白结合、分子结合、ATP结合。砂糖灯笼橘叶、果皮分别存在12个、9个与蜡质生物合成相关的显著差异基因，其中包含5个相同的下调基因，为CER1、CER3、HHT、P45086A8、P45086A22，这些基因极有可能是导致砂糖灯笼橘表面蜡质排布不均的关键基因。【结论】砂糖橘与砂糖灯笼橘性状差异明显，转录组数据显示叶的差异基因数量最多，其中叶和果皮中存在5个表达趋势一致的相同蜡质合成基因，可能是导致砂糖灯笼橘表面蜡质缺失的关键基因。