甜樱桃品种中新多态性SSR的鉴定、指纹图谱构建及聚类分析

摘要：【目的】应对迅速增加的甜樱桃品种及其分子鉴定需求，储备一批新多态性SSR，并获得其在甜樱桃品种中的 基因型数据。【方法】从甜樱桃基因组测序开发的SSR库中，根据重复单元和重复次数在8条染色体上一共选择了96个 SSR。用 ABI3730，鉴定出其中 9个 SSR 在 4个代表甜樱桃品种中具有多态性。另外从 305个李属 SSR 中又鉴定出 9 个多态性SSR。用S基因和多态性SSR排除了52个品种122个单株中S基因型不正确和混杂的品种或单株，然后用多 态性信息比价高的11个SSR（其中包括8个新SSR）和S基因标记，构建了48个甜樱桃品种的指纹图谱库，并获得了可 以区分48个品种的最少标记组合。【结果】聚类分析表明，48个甜樱桃品种组成了短低温组、中国组、北美组和东欧组。 聚类分析结果可以和品种间亲缘关系及地域来源互相验证。【结论】鉴定了3个从未报道的甜樱桃品种的S基因型，验 证了一种可以有效获得多态性 SSR的途径，提供了 9个新的多态性 SSR及其等位基因大小，用 12个分子标记构建了 48个甜樱桃品种指纹图谱。本文提供的新SSR及其构建的甜樱桃品种指纹图谱真实可靠。