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香蕉GRF基因家族的全基因组鉴定及表达分析

发布日期:2023/4/6 9:31:10 浏览次数:
作者:田 娜,刘范,伍俊为,刘嘉鹏,李 丹,付 帅,黄玉吉,程春振
关键词:香蕉;生长调控因子;果实成熟;温度胁迫;表达模式
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20200226
全文: PDF 摘要

摘要:【目的】生长调控因子(Growth-regulating factorsGRF)是植物特有的一类转录因子,在植物生长发育和抗逆防 御过程中发挥着重要作用。为揭示香蕉GFR基因等功能,对小果野蕉生长调控因子(MaGRF)基因家族进行全基因组 鉴定和分析,并研究其在香蕉果实成熟和低温胁迫应答过程中的表达模式。【方法】使用生物信息学软件对MaGRFs家 族成员进行全基因组鉴定和分析,基于转录组数据分析MaGRFs在自然成熟和乙烯催熟的香蕉果实成熟过程及4 ℃ 低温处理叶片中的表达情况。【结果】共鉴定获得可归为4个亚家族的20MaGRF成员,其中15个成员被预测为miRNA396的靶基因。MaGRFs启动子上存在大量的植物激素、胁迫响应以及生长发育相关的顺式作用元件和9种转录 因子家族的结合位点。转录组结果显示,MaGRF7在自然成熟的果实中高水平表达;MaGRF13在自然成熟和乙烯催 熟的果实中均高表达;属于第Ⅰ和第Ⅱ亚家族的多个MaGRFs在果实成熟过程中差异表达显著;低温处理显著诱导 MaGRF914151819的表达,显著抑制MaGRF2613的表达。【结论】香蕉GRF家族成员较多,它们的表达大多 受miR396调控。第Ⅰ和第Ⅱ亚家族的MaGRF成员在香蕉果实成熟和低温应答过程中发挥着重要作用。