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菠萝TCP基因家族的鉴定及成花 诱导阶段的表达谱分析

发布日期:2023/4/4 16:28:13 浏览次数:
作者:阮城城,胡福初,罗志文,王祥和,郭利军,李玉静,范鸿雁,韩冰,陈哲,张治礼
关键词:菠萝;TCP基因;基因家族;表达分析
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20200165
全文: PDF 摘要

摘要:【目的】筛选并分析菠萝TCPTeosinte branched 1/Cycloidea/Proliferating)基因家族,为菠萝TCP基因在乙烯利 诱花过程中的功能研究提供参考。【方法】以‘台农16号’菠萝为材料,通过生物信息学软件系统地分析该基因家族的 蛋白质理化性质、染色体定位、基因共线性、系统进化、基因结构、启动子顺式作用元件及RNA-Seq数据,并通过qRTPCR分析该基因家族在成花诱导阶段的表达情况。【结果】共鉴定出9个菠萝TCP基因,均含有TCP结构域,系统进化 将其划分为PCF、CIN和CYC/TB1三个亚家族。菠萝TCP基因家族的扩增与全基因组倍增事件无关,不存在片段复 制和串联复制事件。启动子顺式作用元件分析发现,AcTCP2AcTCP5~AcTCP9均含有乙烯响应元件。表达谱分析表明,AcTCP对乙烯利均有不同程度的响应,在花芽分化时期,AcTCP1AcTCP3AcTCP7AcTCP8在茎尖中的表达水平均有显著上调,分别约为0时期的8.15、18.0、14.6和7.91倍。【结论】鉴定并分析了AcTCP基因家族成员信息,发现 AcTCP1AcTCP3AcTCP7AcTCP8在花芽分化时期高度表达,AcTCP3在乙烯利处理1 h后显著上调,表明其可能与 乙烯利诱导菠萝成花过程密切相关。