- 作者:骆 翔,曹尚银,李好先,赵弟广,张富红,陈丽娜,Krishna Poudel,敬 丹,唐丽颖
- 关键词:石榴;SUT;基因家族;籽粒;表达分析
- DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20190351
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摘要:【目的】对石榴SUT家族基因成员进行全基因组鉴定,并分析SUT家族基因成员的结构域特征、启动子序列、生 化特征、进化关系和表达特性,为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考。【方法】利用同源比对及HMMER 模型鉴定石榴SUT基因家族成员;利用邻近法和基因结构分析解析石榴SUT基因及其启动子序列的系统发生关系。 【结果】共鉴定了10个石榴SUT基因,可以分为3大类;石榴SUT基因及其启动子区的GC含量都明显低于其在拟南芥 和水稻中的含量;石榴SUT家族基因GC含量远高于启动子区的GC含量;石榴SUT基因的序列长度与GC含量呈明显 正相关;石榴 SUT 基因启动子区含有 10 种 MYB 元件;此外,4 个石榴 SUT 基因 (PgL0328370.1、PgL0099690.1、 PgL0145810.1和PgL0145770.1) 在籽粒发育过程中发生了差异表达。【结论】SUT基因在进化过程中其序列和基因结构 相对保守,而其启动子序列在进化过程中变化较大,SUT基因的表达量变化与籽粒发育显著相关。