7个蔷薇科物种HPL基因家族的鉴定和特性分析

摘要：【目的】利用生物信息学方法对7个蔷薇科HPL基因家族进行分析，以期更深入地了解蔷薇科HPL家族基因特 性，在分子水平上为蔷薇科品种的研究和改良提供候选基因。【方法】用拟南芥HPL基因鉴定白梨、苹果、桃、草莓、西 洋梨、黑树莓、梅七种蔷薇科物种的HPL基因，分析HPL基因的结构、保守域、系统进化关系、正选择作用、共线性关系 和表达情况。【结果】鉴定确定了31个HPL基因，其中白梨6个，苹果4个，桃3个，草莓5个，西洋梨4个，黑树莓6个，梅 3个；大多包含1个或3个内含子；系统进化树显示，HPL基因家族分为A、B和C 3个亚族；进化树上9个节点M0模型 的ω都远小于1，平均数为0.174 8；梨、苹果、桃和梅HPL基因间存在较强的共线性关系；梨和苹果果实中检测到HPL 基因表达。【结论】鉴定了7个蔷薇科物种共31个HPL基因，每个物种均不少于3个，正选择效应在HPL基因上作用明 显。苹果的MDP0000424398、MDP0000225501和梨的Pbr041820.1为表达活跃的功能基因。梨主要表达的HPL基因 属于C亚族，苹果主要表达的HPL基因属于B亚族。