基于microRNA测序分析miRNA在刺葡萄抗白腐病中的作用

摘要：【目的】在前期的种质资源评价过程中, 发掘一株中国野生刺葡萄0943, 该株系高抗葡萄白腐病。基于mi-croRNA (miRNA) 在植物抗病中的重要作用, 拟从miRNA水平探讨刺葡萄在受到病原菌侵染后的表达调控机制。【方法】以抗病的中国野生刺葡萄为试材, 对比感病的欧亚种'美人指’, 分别以病原菌诱导, 在0 hpi (hours post inoculation) 和病菌诱导后的12 hpi、36 hpi处理后采样, 进行二代测序, 并对数据进行KEGG及表达量的差异分析。【结果】对比感病葡萄'美人指’, 分析了抗病刺葡萄在基础代谢和抗病途径中的差异, 结合miRNA的表达量, 获得了150个表达量发生变化的miRNA, 其中44个miRNA的表达在刺葡萄和'美人指’之间存在差异。5个miRNA在刺葡萄中特异表达, 但是在'美人指’中不表达, 实施定量验证了这一结果。靶基因预测显示, 其靶基因包括与抗病的紧密相关的WRKY、SPL、EFR等转录因子, 还包括与抗病直接相关的LRR类的抗病基因。【结论】筛选出5个在刺葡萄上特异表达候选miRNA (miR172a、miR172b、miR845a、novel＿81和miR159a) , 可作为刺葡萄抗白腐病研究的目标。