桃同株花色叶色嵌合体差异表达基因的cDNA-AFLP分析

【目的】从转录水平初步探索桃同株花色叶色嵌合体颜色变异的分子机理。【方法】利用cDNA-AFLP技术,筛选桃嵌合体无性繁殖分离获得的不同颜色花瓣差异表达的基因;挑选差异片段进行克隆、测序和基因比对分析;利用qRT-PCR分析差异基因在不同基因型花和叶片中的转录表达。【结果】256对cDNA-AFLP引物共获得19个在粉色和白色花瓣之间具有差异的TDFs;克隆测序后成功获得其序列。Blastx比对和功能分类分析表明,17个TDFs与已知功能基因具有较高的相似值,8个涉及信号转导、5个涉及代谢过程、2个涉及细胞分化、1个涉及光合作用、1个涉及转录调控。选取12个在桃基因组中明确注释的TDFs进行qRT-PCR验证,结果发现5个基因(ppa005282m、ppa025850m、ppa001038m、ppa010768m、ppa023284m)在白花、绿叶基因型中表达量高,2个基因(ppa007494m和ppa015603m)在粉(或红)花、紫红叶片基因型中表达量高。【结论】桃嵌合体颜色变异可能涉及信号转导、代谢、转录调控等多种途径相关的生理、生化反应协同调控。