【目的】为科学保存和利用贵州李资源提供理论依据。【方法】采用ISSR分子标记技术对45份贵州李资源和3个美国引进品种进行遗传多样性分析,并进行亲缘关系鉴定。【结果】27条引物共扩增出198条DNA谱带,其中多态性条带181条,占扩增总带数的91.41%。供试材料Nei’s遗传多样性指数(H)为0.041 2~0.499 2,Shannon信息多样性指数(I)为0.102 1~0.693 1,遗传相似系数为0.50~0.93,表明贵州李资源遗传多样性丰富。在相似系数0.67处,48份李资源被聚为6组,其中2份鸡心李资源、2份九阡李资源、3份玉皇李资源以及4份酥李资源分别为同名异物。【结论】贵州李资源具有丰富的遗传多样性;采用该分子标记技术区分了同名异物的李资源。