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基于p23 基因的野生柑橘和栽培柑橘上 衰退病毒分离株间的遗传特征分析基于p23 基因的野生柑橘和栽培柑橘上 衰退病毒分离株间的遗传特征分析

发布日期:2017/7/12 15:06:30 浏览次数:
作者:易龙,周常勇
关键词:野生柑橘;栽培柑橘;柑橘衰退病毒;p23 基因;遗传特征
DOI:10.13925/j.cnki.gsxb.20170035
2017,34(7):828-834
全文: PDF 摘要

摘要【目的】比较分析野生柑橘与栽培柑橘上衰退病毒(CTV)分离株间的分子遗传特征,为深入解析CTV的遗传进化提供相关依据。【方法】运用RT-PCR对我国云南、广西、四川、湖南、江西等省(区)的11个野生柑橘上的CTV分离株和4个国内栽培甜橙及柚上的CTV强弱毒代表株分离株的p23 基因进行扩增、测序,所获序列与GenBank收录的具有代表性的国外CTV分离株的相应基因序列进行比对分析。【结果】野生柑橘与国内外栽培柑橘上CTV分离株的p23基因序列相似率为87.7%~99.3%;密码子中碱基含量GC%,密码子转换数多于颠换数,第3位的碱基替换数最多,其次为第1位,最少是第2位;非同义突变与同义突变的比值(dN /dS)小于1,表明p23 基因在进化过程中承受着净化选择。系统聚类分析表明,来自于野生柑橘上的11CTV分离株在构建的系统发育树中分属不同的簇支,与不同来源地具有较高相似性和较低遗传距离的栽培柑橘上的CTV分离株构成同一组群。【结论】野生柑橘与栽培柑橘上的CTV分离株在碱基含量、密码子转换和颠换率及非同义突变与同义突变比值(dN /dS)等遗传特征方面均表现出一致性,系统发育分析表明,野生柑橘上CTV分离株基于p23 基因序列的聚类关系与其地理来源之间无明显相关性。