基于p23 基因的野生柑橘和栽培柑橘上 衰退病毒分离株间的遗传特征分析基于p23 基因的野生柑橘和栽培柑橘上 衰退病毒分离株间的遗传特征分析

摘要：【目的】比较分析野生柑橘与栽培柑橘上衰退病毒（CTV）分离株间的分子遗传特征，为深入解析CTV的遗传进化提供相关依据。【方法】运用RT-PCR对我国云南、广西、四川、湖南、江西等省（区）的11个野生柑橘上的CTV分离株和4个国内栽培甜橙及柚上的CTV强弱毒代表株分离株的p23 基因进行扩增、测序，所获序列与GenBank收录的具有代表性的国外CTV分离株的相应基因序列进行比对分析。【结果】野生柑橘与国内外栽培柑橘上CTV分离株的p23基因序列相似率为87.7%~99.3%；密码子中碱基含量GC%，密码子转换数多于颠换数，第3位的碱基替换数最多，其次为第1位，最少是第2位；非同义突变与同义突变的比值（dN /dS）小于1，表明p23 基因在进化过程中承受着净化选择。系统聚类分析表明，来自于野生柑橘上的11个CTV分离株在构建的系统发育树中分属不同的簇支，与不同来源地具有较高相似性和较低遗传距离的栽培柑橘上的CTV分离株构成同一组群。【结论】野生柑橘与栽培柑橘上的CTV分离株在碱基含量、密码子转换和颠换率及非同义突变与同义突变比值（dN /dS）等遗传特征方面均表现出一致性，系统发育分析表明，野生柑橘上CTV分离株基于p23 基因序列的聚类关系与其地理来源之间无明显相关性。